Tarihi Kılıç Ali Paşa Medresesi restorasyon çalışmaları, önceden hazırlanan restorasyon ve restitüsyon projeleri doğrultusunda yürütülmektedir. Medrese, Osmanlı döneminde eğitim ve dini faaliyetler için uzun yıllar hizmet vermiş olup, yapının tarihî kimliği ve mimari özellikleri korunarak restorasyon süreci planlanmıştır.

Restorasyon kapsamında, medresenin özgün taş ve ahşap işçiliği detaylı bir şekilde incelenmiş, hasar görmüş bölümler özenle onarılmış ve gerekirse aslına uygun malzemelerle yeniden uygulanmıştır. Ayrıca yapının çatı, revak ve iç mekân süslemeleri restorasyon ekipleri ve konservatörler gözetiminde tamamlanmış, binanın dayanıklılığı ve estetik bütünlüğü sağlanmıştır.

Bu restorasyon çalışması, medresenin tarihi ve kültürel değerlerini koruyarak gelecek nesillere aktarmayı amaçlayan örnek bir uygulama olarak öne çıkmaktadır.